Calitatea apei potabile are o influenta covarsitoare asupra sanatatii populatiei. Daca apa consumata este infestata, riscurile de imbolnavire sunt foarte mari, afectiunile ce pot aparea fiind: diareea, febra tifoida, hepatita A, salmoneloza, malaria etc. De asemenea, unele boli netransmisibile sunt considerate ca fiind determinate sau favorizate de compozitia chimica a apei: gusa endemica, caria dentara, afectiunile cardiovasculare, intoxicatiile cu plumb, intoxicatiile cu cadmiu, cianuri, crom etc. In apa pot exista si poluanti organici, dar majoritatea acestora produc modificari organoleptice evidente, ceea ce duce la limitarea utilizarii apei de baut, pentru prevenirea riscurilor imbolnavirilor. Cei mai cunoscuti poluanti organici sunt pesticidele ce pot afecta ficatul, sistemul nervos, glandele endocrine (sexuale) etc.